Fri, Mar 19 - りんばらの Hatena Diary

！！！！！！！！！！注意！！！！！！！！！！

こちらは、2010年3月19日の日記の続きです。

！！！！！！！！！！注意！！！！！！！！！！

15:09 部屋全体の雰囲気がわかります。RT @chalkless: 写真アップ。アイコンで顔バレしているからいいか、ということで。 http://tinyurl.com/ycqr48t #togofarm
15:14 RT @kishu_no_sue: 辞書を作る際には機械学習の技術を使う。言葉の法則性を機械で処理するための記述は複雑すぎるので人手だと処理しきれない#togofarm
15:14 RT @kishu_no_sue: パーセプトロンなどのアルゴリズムを使うそうです。パーセプトロンの説明はキャパオーバーなので省略・・・
15:15 RT @bonohu: 現在見せているページ QT @syou6162: http://bit.ly/bi9jPr #togofarm #togofarm
15:16 RT @kishu_no_sue: 「タンパク質核酸酵素」（雑誌名）から特徴語を抽出し、年ごとに解析。その年の傾向を知る。多い単語を抽出の上、あまりに一般的なものは間引く#togofarm
15:18 RT @bonohu: http://bit.ly/dq9l3u #togofarm
15:18 RT @kishu_no_sue: ある単語について年ごとの関連用語も知ることができるhttp://bit.ly/bi9jPr #togofarm
15:18 RT @bonohu: merit: 研究室以外でのつながりが出来る、分野外での知り合いができる、自分が詳しくないことは教えあえる　ー＞自分の理解も深まる #togofarm
15:20 RT @bonohu: 「言われたことをやるのが楽だから、というひとはDBCLSのRAには向かないかも」 by @syou6162 #togofarm
15:20 RT @kishu_no_sue: Q.「パーセプトロンで、重要だけど得点の低い単語はないか？」#togofarm
15:21 RT @kishu_no_sue: A.「基本的には上の方に専門用語でないものが来ないようにする方向で作っている」#togofarm
15:21 RT @kishu_no_sue: SBMじゃなくてパーセプトロンなのは、何度か試した結果精度上の差がそれほど無く、処理速度が速いから#togofarm
15:24 RT @kishu_no_sue: 略語の処理については？処理に組み込むか？ー＞まだしてはいない。カテゴリ分けなど共々後々の課題。#togofarm
15:26 @iNut フォローさせて頂きました。主にがん細胞で実験する仕事をしています。 [in reply to iNut]
15:27 RT @iNut: 次は天気予報bot@mickey24_botのアレこと@mickey24の発表です！ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
15:29 RT @y_benjo: 24が@body3dを作った話 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
15:29 RT @kishu_no_sue: アナトモグラフィー：人体臓器の3Dモデルをwebブラウザ上で表示できるhttp://lifesciencedb.jp/ag #togofarm
15:34 [B!] 雨予報bot「mickey24_bot」の使い方 ver 2.0 - ぬいぐるみライフ(仮)@mickey24_bot http://bit.ly/b66mUM 雨予報bot「mickey24_bot」の使い方 ver 2.0 - ぬいぐるみライフ(仮)
15:35 @mickey24_bot フォローさせて頂きました。（短時間降雨予報bot．「○○の雨」と話しかければその場所の向こう5時間の雨予報をしてくれる(例:新宿の雨予報教えて)．雨予報の自動配信もやってくれる．）
15:36 @mickey24 フォローさせて頂きました。主にがん細胞で実験する仕事をしています。 [in reply to mickey24]
15:38 [B!] ぬいぐるみライフ(仮)@mickey24 http://d.hatena.ne.jp/mickey24/ ぬいぐるみライフ(仮)
15:40 [B!] Anatomography Wiki - FrontPage@body3d http://g86.dbcls.jp/~body3d/index.php?FrontPage Anatomography Wiki - FrontPage
15:41 @body3d フォローしました。（指定した臓器の3D画像を配信します．）
15:42 RT @y_benjo: 就活に関するわけわかんないこと呟いてるbotは@shukatsu_ngです
15:42 RT @kishu_no_sue: 臓器の指定、色の指定、透明度の指定、複数の臓器の描画、などが可能#togofarm
15:42 （笑）RT @kishu_no_sue: 色は紫はオススメできません。大事なことなので二k（ry #togofarm
15:43 UNIXをかじろうとして挫折。RT @kishu_no_sue: コマンドラインみたいな操作って一見とっつづらいのですが、なれればその方が楽ですよね。
15:43 RT @kishu_no_sue: jRuby スクリプトを使って開発。毎分毎分スクリプトが実行されてReplyを受けた時にアナトモグラフィーのサーバに送る#togofarm
15:43 RT @kishu_no_sue: Twitter botを作ればみんなに使ってもらえるのではないかと思って作った#togofarm
15:44 RT @yoh2: 利用者からの喜びの声 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
15:44 RT @kishu_no_sue: 改善したい点は指定方法の簡略化、表記揺らぎ対策、挨拶への対応でユーザフレンドリーに #togofarm
15:44 RT @kishu_no_sue: DNAマッピングの分散処理について。マッピング(塩基配列・形質を染色体上に位置づける)をクラスタ環境で分散処理する。染色体ごとに並列処理できる#togofarm
15:45 RT @syou6162: 表記のゆらぎとかは自然言語班の出番ですね #togofarm
15:45 面白いです。RT @syou6162: twitter bot作ってた人がDNAマッピングの分散処理もやるような職場です #togofarm
15:48 RT @body3d: @iNut 404 臓器 Not Found: 肝臓 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x): 指定可能な臓器名の一覧はこちらです http://bit.ly/1jPydp 1
15:50 RT @kishu_no_sue: 遺伝子と染色体と塩基配列とって話は、専門にしてないとごちゃごちゃになりがちですけど、＝でつなげるわけじゃありませんしね。
15:52 RT @_b_g: DNAマッピングはエンパラってこと？ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
15:52 RT @_b_g: embarrassingly parallelです。完全に並列化できるかどうかってことです。 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
15:53 RT @y_benjo: @_b_g 今解いてる問題では大丈夫だそうです (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
15:54 RT @h_ono: 前半の部終了　再開は16:20の予定です (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
15:56 ライブ映像と音声（Ustreem）と同時にtwitterでつながる経験が初めてで、楽しいです。(#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
15:57 @h_ono フォローさせて頂きました。主にがん細胞で実験する仕事をしています。 [in reply to h_ono]
15:59 収穫祭、という表現もいいですね。RT @yoh2: これはいい収穫祭ですね！ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:08 不明な臓器と診断された^_^;RT @body3d: @rinnbara 不明な臓器です: フォローしました。（指定した臓器の3D画像を配信します．）: 指定可能な臓器名の一覧はこちらです http://bit.ly/1jPydp
16:09 RT @mickey24_bot: @rinnbara フォローさせて頂きました。（短時間降雨予報bot．「○○の雨」と話しかければその場所の向こう5時間の雨予報をしてくれる(例:新宿ってどこ？ちょっと分からない＞＜
16:09 RT @mickey24_bot: @rinnbara こんにちはこんにちは！私の使い方はこちらを参考にしてください！ http://d.hatena.ne.jp/mickey24/20090505/mickey24_bot
16:11 @kishu_no_sue いえいえ、分かりやすい中継で、ありがたいです。今夜、RTさせて頂いたのをもとに、旦那に話しようと思っています。（旦那は、bonohuさんと知り合いです。） [in reply to kishu_no_sue]
16:23 [B!] Ｄｒ.フキコ公式サイト@drfukiko http://drfukiko.jp/ Ｄｒ.フキコ公式サイト
16:25 @drfukiko さん、初めまして。フォローありがとうございます。ワーキングマザーの先輩として、フォロー返しさせて頂きました。シングルで二児を子育たとは、本当に凄いですね。
16:27 RT @iNut: AJACS17、再開します！！！！！！ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:27 RT @kishu_no_sue: Next!!!: @yag_ays さん!!! #togofarm
16:28 RT @y_benjo: 統合TVの話や http://togotv.dbcls.jp/ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:28 RT @kishu_no_sue: 自分も統合TV作っております。見習いちう #togofarm
16:29 RT @iNut: 統合TV職人・やぐさんの発表です。統合TVはこちら→ http://togotv.dbcls.jp/ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:29 RT @bonohu: 例はJalviewの統合TVで http://bit.ly/dxGawa #togofarm
16:30 RT @kishu_no_sue: ライフサイエンス分野のツールの使い方の解説・DBCLS関連の講習会の動画などがあがっております。http://togotv.dbcls.jp/ #togofarm
16:30 RT @iNut: ニコニコ動画にもあるよ！！！ http://www.nicovideo.jp/user/4112045 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:31 RT @kishu_no_sue: 生命系データベース・ツールは更新が早い。書籍だとすぐに古くなって追いつけないのでネットで維持する #togofarm
16:32 RT @yoh2: 「誰が喜ぶの？」ってすごく大事な視点だと思う。研究者はこれすぐ忘れちゃうんだけど。 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:32 RT @kishu_no_sue: 学生に限らず、ツールを使い慣れていない人たちすべてが対象。ウェット（実験系）ドライ（計算科学系）の間の橋渡しをする #togofarm
16:32 RT @kishu_no_sue: タグの管理とかも大事。 #togofarm
16:34 RT @flash1n: やぐさんのスライドは統合TVの内容を分析したデータがいっぱい！ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:35 primer3は有名です。RT @Satoyo314: プライマー設計ツールなんてあったんだー (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x) 1 minute ago
16:36 RT @iNut: まさかの統合TV公開収録……!! (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:41 RT @kishu_no_sue: .@togotv から更新情報が見れます。
16:41 そうですか〜RT @kishu_no_sue: 慣れないうちは2分くらいの動画作るのに10時間以上かかります＞＜ #togofarm
16:43 RT @dritoshi: 動画作成ソフトの名前を聞き逃した... (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:43 RT @y_benjo: @dritoshi desktoptomovieですね http://pencilsoftware.com/dtm.html (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:44 RT @iNut: @dritoshi やぐさんのタグクラウドは http://www.wordle.net/ 謹製だったと思います (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x) 3 minutes ago
16:45 RT @mokjpn: OmniDazzle http://bit.ly/bR2j7o とか使うともっと派手にできそう (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:46 RT @h_ono: 統合TVの作り方＠DesktoptoMovie http://togotv.dbcls.jp/20080709.html#p01">#p01">http://togotv.dbcls.jp/20080709.html#p01 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:47 RT @syou6162: Tsukuba.RのメンツとDBCLSでバイトしてるメンツは結構被ってますw #togofarm
16:49 専攻以外にやれる余裕があるのが素晴らしい。RT @wakuteka: yagさん「専攻の勉強しかしちゃいけないなんてことはない」これは金言
16:50 RT @iNut: 次はhmmerやりましょう (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:50 RT @h_ono: 未公開映像流出 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:51 不審の目線？RT @yoh2: 「未公開映像」で噴いた。中ボスから不審の目線。 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:51 RT @wakuteka: http://togodb.dbcls.jp/togotv_show?search=yag_ays やぐさん作動画リスト #togofarm
16:53 RT @iNut: 次はいよいよお待ちかね！@y_benjo先生のプレゼンだァーッ！ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:54 そうですか。RT @h_ono: 参加者のみなさんには未公開ネタ帳までっ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:54 そうですよねぇ。RT @yoh2:学部1〜2年の暇な時にやったらよかった・・・とおじさんになった今、強く思います。 RT: @rinnbara 専攻以外にやれる余裕があるのが素晴らしい。RT @wakuteka:yagさん「専攻の勉強しかしちゃいけないなんてことはない」これは金言
16:55 RT @kishu_no_sue: Next: @y_benjo さん！先ほどまでスライドなどの最終チェックに余念がありませんでした #togofarm
16:55 RT @h_ono: つづいては　17:00-17:30 「統合TVのシステムを良くする仕事」　です (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
16:57 そうでしたか。RT @yoh2: 急に噴いたので、不審者を見るような目つきで見られたってことで・・・。 RT: @rinnbara 不審の目線？
16:57 RT @kishu_no_sue: アクセスログ収集・分析、クエリ作成して類似した番組を推薦するシステムを作るお仕事。 #togofarm
16:58 RT @kishu_no_sue: どういうところから統合TVにアクセスしたかなど収集しています #togofarm
16:58 RT @kishu_no_sue: tDiary用プラグイン。タグなどから類似した番組を選び出す #togofarm
17:09 娘が大量のウンチをして、服を汚してしまったため、途中から見れなかった。休憩中ですか。。
17:10 RT @kishu_no_sue: クエリはDBCLSの全サービスについて分析している。経由している検索クエリの検索、盛り上がっているキーワード（あまりうまくいってないそう。。。）の分析 #togofarm
17:10 そうですか。RT @kishu_no_sue: kazusaWCー＞論文と被言及遺伝子の対を調べる。ちょっと聞きそびれた。。。 #togofarm
17:11 始まった！RT @iNut: 便所さんの次はいよいよラスト、あの@iNutが登場！stay tuned!!
17:12 RT @h_ono: 最後は　17:30-18:00 「in silicoな実験を広める仕事」です！ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:13 RT @kishu_no_sue: 次は @iNut さん、牧場に数少ないウェット系です。いつも5時から来られています。一番遭遇率が高い人かも知れません。ただいまカーネルパニックが起きたMacを再起動中 #togofarm
17:14 エヴァ好きなんですね。RT @bonohu: 8th children, 最後のシ者 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:15 RT @kishu_no_sue: iNutさんは植物の病理学が専攻だそうです。 #togofarm
17:17 何の事でしょうか。。（見逃しました。）RT @yag_ays: ZENプレゼンテーションや #togofarm
17:18 RT @flash1n: 統合TVではウェブで字幕もみれるそうです (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:19 見逃したのが悔やまれます。。RT @ma_ko: いきなりﾋﾄは無理かもしれんけど、便利だな。NGSで単一遺伝子疾患の変異探すときとかに欲しい。 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x) 18 minutes ago
17:20 RT @oza_x86: 写真はクリエイティブコモンズの使ってるのかー #togofarm 15 minutes ago
17:21 RT @flash1n: CCの写真探すのに一番時間がかかりました！by 便所先生 #togofarm
17:23 RT @kishu_no_sue: 「ラボの人たちは本当に計算機の使い方を知らない！事務仕事のためのものになっている！」 #togofarm
17:23 RT @kishu_no_sue: 実験メインの人たちも最新のテクノロジーを使ってよりよい研究をしなければ行けない。 #togofarm
17:23 RT @kishu_no_sue: でもじゃぁ何を使えば良いの、何ができるの！？ー＞そのためのDBCLSです。 #togofarm
17:23 RT @kishu_no_sue: 有用で使いやすいツールはたくさんある。ウェット系の人たちもそういうツールを使うべき。 #togofarm
17:23 RT @bonohu: mission: tutorial for the tools work with the Terminal/UNIX (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:24 UNIXを使いたくてiBookを買った大学時代を思い出す。RT @kishu_no_sue: ブラウザなどは簡単に使えるが、計算機をよりよく活用するためにUNIX、ターミナルを使ったツールの解説をしたい。 #togofarm
17:25 RT @bonohu: Only on TogoTV! (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:27 ありがとうございます。RT @yag_ays: @rinnbara ZENプレゼンテーションというのは，最後の方にちょっとあったスライドのことで，画像を全面に押し出してimageで内容を伝えるプレゼンテーション手法のことです．発表内容とは直接は関係ないです.. #togofarm
17:29 RT @bonohu: ALDH2の配列取得をtogoWSでやっています (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:29 RT @kishu_no_sue: 別の動物の遺伝子の配列を並べて比較する。比較する動物、アルゴリズムの種類の指定などをして実行などなど、コマンドラインからできる。
17:29 RT @flash1n: http://togows.dbcls.jp/entry/uniprot/ALDH2_HUMAN,ALDH2_MOUSE.fastaのようにダウンロードできるそうです (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:30 RT @mickey24: 多分-Oの後に直接ファイル名でもOKですね． #togofarm 5 minutes ago
17:30 RT @mickey24: 自動化しましょう！ #togofarm
17:31 RT @bonohu: ここでのfarm.fastaはさきほどのfarm.mfaとは別なのに注意 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:32 RT @kishu_no_sue: いくつかの動物の配列を並べて、並べた配列の規則性を表すようなモデル（隠れマルコフモデル）を計算。 #togofarm
17:32 RT @bonohu: --informat afaするのはhmmerのversion3.0rc2なためで、まだ完全ではなからです (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:32 RT @kishu_no_sue: 得られたモデルと相同性の高い配列を目標とする生物のゲノム配列からとってこれる。 #togofarm
17:33 RT @ppoottaa: fasta でアライメントするコマンドなんでした？見落とした #togofarm
17:33 RT @bonohu: @ppoottaa clustalw #togofarm
17:34 RT @suzuvie: いくつかのクエリ蛋白質で学習したHmmをつかって、対象配列の尤度高い箇所を引いてる気がする #togofarm
17:34 RT @bonohu: ensemblgenomesのfungi http://fungi.ensembl.org/ (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:35 RT @kishu_no_sue: EnsembleFungi （遺伝子ブラウザ）で、とってきた配列と相同性の高い配列を抽出。ゲノム上のどのあたりにマッピングされているかがわかる。 #togofarm
17:35 RT @kishu_no_sue: これはどういうときに必要か？ー＞ゲノム配列が新たに判明した生物の遺伝子を知ることができる。 #togofarm
17:35 まぁ、当然ですねぇ。（でも、私は使いこなせないのですが。）RT @kishu_no_sue: ブラウザからもできるが、コマンドラインからの方が早くできる。 #togofarm
17:36 RT @kishu_no_sue: こうして出た成果を、ウェットな実験で確かめる。これらのツールは一般的には使いづらいと思われているが、使いやすくするべく解説などしている。 #togofarm
17:36 RT @bonohu: 'make science fair' (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:38 （専門分野的には）当然です。RT @kishu_no_sue: ゲノム配列がわかる＝配列の各部分が生物上で遺伝子がどのような働きをしているかわかる、ではないので・・・。 #togofarm
17:40 @flash1n ありがとうございます。 [in reply to flash1n]
17:41 皆様、お疲れさまでした。楽しませて頂きました。(#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:41 RT @h_ono: これにて統合データベース講演会: AJACS本郷6のUstを終了します (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x)
17:44 別の生物で同じ働きであるとは断定できませんがね。RT @kishu_no_sue: まず遺伝子がわかっている（＝役目がわかっている）配列を調べるー＞別の生物の塩基配列から似たものを探すことで塩基配列から同じ役目を果たしている部分がわかる、ということですね #togofarm
17:48 使いこなしたいですけれど、なかなか。。RT @mamenosuke60:専門家に任せて分業というのもアリだと思いますRT @rinnbara RT @kishu_no_sue:有用で使いやすいツールはたくさんある。ウェット系の人たちもそういうツールを使うべき。 #togofarm
17:52 @tetrahymena 15時から10分前までUstreamとbonohuさん達とtwitterしてた。楽しかったよ！RT @h_ono:..統合データベース講演会:AJACS本郷6のUstを終了 (#togofarm live at http://ustre.am/1x4x) [in reply to tetrahymena]
18:04 @tetrahymena RTしまくったから、またフォロワーが増えた。 [in reply to tetrahymena]
20:09 今日のディズニー英語システムTelephone English は、for Mommy and Daddy でLesson 26:Weather Talk "It's a beautiful day!" 最初の方の”It's nice warm today"をやり直した。（続く）
20:10 ディズニー英語システムTelephone English (続き）”warm”の発音が悪かったそうだ。”or”の発音と同じように発音するように、とのアドバイスだった。やっと、ネイティブの先生（だいぶゆっくり話してくれているはずだが）の言っていることが、聞き取れるようになってきた。
20:12 ディズニー英語システムTelephone English。訂正。誤”It's nice warm today"→正”It's nice and warm today"。とにかく、レッスンらしくなってきて嬉しい。
22:00 ガーゼ＆パイル　ハンカチ（抗菌防臭加工)３枚（ピンク、ブルー、イエロー）→http://ow.ly/1oqj2 とふわふわガーゼバスタオルとベアーズパーク　バスタオル/ブルー（最後の一枚）が届きました。思った以上に、薄くてびっくりしました。
22:02 ありがとうございます。RT @flash1n: @rinnbara そういう本があるとか http://ow.ly/1oqml
22:06 @87uttie iPhoneなんですね。通勤電車で便利なんですね。買う決意まであと一歩なんですが。 [in reply to 87uttie]
23:38 えぇ、そんなに！！食事、弁当タグをつけたからかな。RT @togetter_jp: .@rinnbara さんの「炊飯時に生ｼﾞｬｶﾞｲﾓをﾎｲﾙで包んで一緒にﾎﾟﾝ」が250PVを超えました。おめでとうございます！ http://togetter.com/li/10049
23:44 @carell_herenow: これ便利！佐光紀子さんの本で読んでからやってます！うちは農薬が心配なのでアルミを敷いて皮剥きます。 @rommbara: @carell_herenow 佐光紀子さん.. http://togetter.com/li/10049
23:46 @carell_herenow: @rinnbara その本です！妊娠中「よし、とことん家事を減らす！」と決意しました。佐光さんには今やメジャーな重曹やクエン酸活用を（本やネットで）教えられ、私の心の師.. http://togetter.com/li/10049